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適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex

 更新時間:2020-06-05 點擊量:1219

paragongenomics適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

 

該基于擴增子的SARS-CoV-2 NGS面板專為COVID19冠狀病毒研究和監測而設計,可對負責COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序。該面板專門針對MGI Tech的DNBSEQ平臺。其他版本可用于  Illumina測序平臺。 

SKU:paragongenomics 918001

類別:CleanPlex對于MGI,CleanPlex為MGI現成的使用面板,傳染病,產品,準備到使用NGS面板標簽:靶富集,靶向測序,擴增子測序,多重PCR,下一代測序,定向重測序,NGS面板,NGS測定,PCR擴增子測序,SARS-CoV的-2 ,研究面板,COVID19,2019-nCoV,傳染性疾病監測

產品描述

用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板,用于通過MGI Tech的DNBSEQ平臺上的下一代測序(NGS)的基于擴增子的靶標富集檢測,跟蹤和研究COVID19冠狀病毒

Paragon Genomics設計了一個高度多重的靶標富集板,覆蓋了SARS-CoV-2病毒的整個基因組(末端的92個堿基除外)。該小組能夠對負責COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序和流行病學研究。借助Paragon Genomics CleanPlex技術,可在5小時內將病毒的整個基因組從RNA擴增到序列就緒的文庫。該面板的兩個版本可用于兩個主要的測序平臺:Illumina和MGI。CleanPlex技術可輕松,靈活地對樣品進行測序,以確保對傳染病的監測和研究。

 

強調

  • 節省大量成本
    降低測序成本98%。許多散彈槍宏基因組測序方法所需的每個樣品僅需要0.2M讀數,而  1000萬個讀數。
  • 目標區域的高覆蓋率
    整個SARS-CoV-2基因組的覆蓋率達到99%
  • 靈敏檢測
    可以高置信度檢測多達1個拷貝,而RT-qPCR可以檢測3-5個拷貝(1)
  • 快速,簡化的工作流程
    使用快速的四步協議(包括RT步驟)以少的動手時間,只需5.5小時即可生成可測序的文庫。
  • 性能超群
    準備高質量的NGS庫具有優良的對目標使用CleanPlex技術,使高效利用測序讀取性能。CleanPlex專家組的準靶率通常比混合捕獲的小靶標富集專家組的靶率高得多。

 

CleanPlex SARS-CoV-2面板包含帶有RT組件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向庫試劑盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ®  磁珠單獨訂購完成從輸入RNA工作流測序就緒NGS庫。

 

儲存溫度

儲存在-20°C。

 

(1)Corman VM等。通過實時RT-PCR檢測(2019-nCoV)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

僅供研究使用。不用于診斷過程。


(左)使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的質粒,通過一個單一的工作流程進行檢測,顯示了低拷貝數下的檢測率。結果表明,檢出率為1.1份時為56%,當存在2份以上時為100%。通過使用兩個池來覆蓋整個病毒基因組,預期靈敏度只會進一步提高。(右)對于檢測到的這些,該小組能夠平均捕獲10倍讀取深度范圍內的所有靶標,以獲得2.8個病毒拷貝,類似地,除了一個靶標外,所有靶標均捕獲1.4個病毒拷貝。所有目標也均勻分布在整個GC范圍內。

 

附加信息

包裝尺寸(反應)

8、96、384

 

 

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